Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SREBF2Q12772 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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