Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM27E3Q08E93 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms