Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms