Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DSG1Q02413 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms