Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TFAMQ00059 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms