Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P63121 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HERVK_113P63121 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms