Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTTPP55157 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTTPP55157 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MTTPP55157 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms