Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLK1P49759 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLK1P49759 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLK1P49759 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms