Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NESP48681 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NESP48681 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NESP48681 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NESP48681 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NESP48681 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NESP48681 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms