Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
XCR1P46094 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms