Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGIRP43119 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms