Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRPPRCP42704 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms