Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MDH1P40925 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MDH1P40925 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MDH1P40925 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MDH1P40925 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms