Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPB2P35606 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPB2P35606 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms