Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPN4P29074 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.8 ms