Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB2P29033 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB2P29033 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB2P29033 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GJB2P29033 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms