Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCAP28676 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCAP28676 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCAP28676 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCAP28676 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCAP28676 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCAP28676 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCAP28676 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCAP28676 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCAP28676 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCAP28676 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCAP28676 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms