Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHATP28329 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHATP28329 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CHATP28329 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHATP28329 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHATP28329 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHATP28329 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHATP28329 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHATP28329 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHATP28329 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHATP28329 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHATP28329 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHATP28329 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHATP28329 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CHATP28329 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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