Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRGP23470 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRGP23470 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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