Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms