Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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