Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CCL3L1P16619 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CCL3L1P16619 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CCL3L1P16619 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CCL3L1P16619 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CCL3L1P16619 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CCL3L1P16619 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CCL3L1P16619 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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CCL3L1P16619 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CCL3L1P16619 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCL3L1P16619 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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