Protein–RNA interactions for Protein: P13985

HRES1, Putative HTLV-1-related endogenous sequence, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRES1P13985 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
HRES1P13985 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
HRES1P13985 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms