Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-EP13747 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms