Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DMDP11532 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DMDP11532 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DMDP11532 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DMDP11532 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DMDP11532 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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