Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMP1P11279 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMP1P11279 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMP1P11279 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMP1P11279 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMP1P11279 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMP1P11279 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMP1P11279 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMP1P11279 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMP1P11279 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMP1P11279 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMP1P11279 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMP1P11279 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMP1P11279 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms