Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSLP07711 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms