Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRT6BP04259 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms