Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATE1O95260 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATE1O95260 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATE1O95260 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATE1O95260 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATE1O95260 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATE1O95260 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATE1O95260 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATE1O95260 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms