Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMPCBO75439 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms