Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SIN3BO75182 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms