Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PPFIA3O75145 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PPFIA3O75145 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms