Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRICKLE3O43900 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms