Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCAO15360 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FANCAO15360 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCAO15360 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCAO15360 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCAO15360 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCAO15360 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCAO15360 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCAO15360 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCAO15360 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCAO15360 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCAO15360 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCAO15360 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms