Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
CEP290O15078 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CEP290O15078 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CEP290O15078 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CEP290O15078 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
CEP290O15078 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CEP290O15078 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CEP290O15078 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CEP290O15078 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CEP290O15078 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CEP290O15078 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CEP290O15078 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CEP290O15078 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CEP290O15078 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CEP290O15078 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CEP290O15078 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CEP290O15078 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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CEP290O15078 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CEP290O15078 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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