Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DGG1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DGG1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DGG1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms