Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms