Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTNNAL1Q9UBT7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms