Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL42Q9P2K6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms