Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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