Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCM2LQ9NUG4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms