Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms