Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CADM1Q9BY67 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms