Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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IFT27Q9BW83 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFT27Q9BW83 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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