Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UPK3BQ9BT76 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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