Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYT17Q9BSW7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT17Q9BSW7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT17Q9BSW7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT17Q9BSW7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT17Q9BSW7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT17Q9BSW7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT17Q9BSW7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT17Q9BSW7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT17Q9BSW7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT17Q9BSW7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT17Q9BSW7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYT17Q9BSW7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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