Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MGME1Q9BQP7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms