Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms