Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PITX2Q99697 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms