Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRIMPOLQ96LW4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRIMPOLQ96LW4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms